Né à Paris, le 26 mai 1907. Études au lycée Louis-le-Grand, à la faculté des sciences, à la faculté de médecine, à l’institut Pasteur. Interne des hôpitaux (1929), docteur en médecine (1936), médecin des hôpitaux (1946), professeur agrégé à la faculté de médecine (1949), professeur de cancérologie (1956), médecin chef de service à l’hôpital Saint-Louis (1957), membre du Comité consultatif de la recherche scientifique (Comité des douze sages, 1958), professeur de clinique des maladies du sang (1961), directeur de l’Institut de recherches sur les leucémies et les maladies du sang (1961), président du Comité consultatif national d’éthique des sciences de la vie et de la santé (1983).;Jean Bernard est l’un des cinq cents titulaires de la carte des résistants de 1940. Dirige un réseau de résistance dans le sud-est de la France (1942). Incarcéré à la prison allemande de Fresnes (1943).
Docteur honoris causa des universités d'Innsbruck, Liège, Lisbonne, Louvain, Mendoza, Montevideo, Salonique, Santiago, Sherbrooke, Sofia, Rio de Janeiro. Président de la Société internationale d’hématologie. A obtenu le prix Katsunuma (Tokyo, 1960), le grand prix de l’Académie des sciences (1971), le prix de l’Institut de la vie (1973), le prix Jimenez-Diaz (Madrid, 1977), le prix Baillet-Latour (Bruxelles, 1984).
Élu membre de l’Académie des sciences, en 1972, de l’Académie nationale de médecine, en 1973. Élu à l’Académie française, le 15 mai 1975, au fauteuil de Marcel Pagnol (25e fauteuil).
Mort le 17 avril 2006 à Paris.